Eine App speichert ihre Appdaten immer im geschützten Bereich. Ausnahmen sind die Daten, die du explizit über die App selbst im internen Speicher speicherst, wie z.B. bearbeitete Bilder etc.
Das ist einer der Verwendungszwecke neben s.o.
Systembereich ist hier der falsche Begriff. Bis auf die Datenpartition werden alle anderen Partitionen als Systempartitionen bezeichnet. Nicht jede Systempartition stellt ein Dateisystem dar, quf dem sich Daten speichern lassen. Manche Partitionen sind auch ganz einfach nur Binaries, die ausgeführt werden, wie z.B. der Bootloader. Aber alle Systempartitionen sind schreibgeschützt.
Allerdings gibt es auf der Datenpartition bestimmte Verzeichnisse, auf die nur das Betriebssystem zugreifen kann. Dort werden z.B. die Systemeinstellungen gespeichert.
Prinzipiell wird auf der Datenpartition alles gespeichert, was nach dem ersten Boot (sei es nach Kauf oder nach einem Reset) an Daten anfällt.